No segundo dia, Deus fez uma extensão que separou as águas e a chamou de céu. É assim que Gênesis 1:6-8 descreve o que aconteceu.
O relato diz que havia águas abaixo dessa extensão e águas acima dela. Em outras palavras, Deus não criou a água nesse dia; ele estabeleceu uma separação entre elas. O texto não explica em detalhes como eram as águas de cima. Alguns entendem que a descrição inclui as nuvens e a água presente no ar, mas Gênesis não diz isso de forma específica.
Também existe a ideia de que essas águas formavam uma camada ao redor da Terra, que teria caído no dilúvio dos dias de Noé. Essa é uma tentativa de explicar a passagem, não uma afirmação da Bíblia. Gênesis 1 não descreve essa camada nem diz que ela causou o dilúvio.
Então, a resposta mais segura é simples: no segundo dia, Deus fez o céu e, por meio dele, separou as águas. O foco do relato é mostrar Deus organizando aquilo que havia criado.