Gênesis não explica por que Deus deixou Caim vivo. O que o texto mostra é que Deus não ignorou o assassinato: ele julgou Caim, deu a ele uma punição dura e proibiu que outra pessoa o matasse por vingança.
Caim trabalhava com a terra. Depois que ele matou Abel, Deus disse que o solo já não produziria pra ele como antes e que ele viveria como fugitivo e errante (Gênesis 4:2, 11-12). Caim entendeu a gravidade da sentença. Ele disse que seu castigo era grande demais e temeu que alguém o encontrasse e o matasse (Gênesis 4:13-14).
É nesse momento que Deus coloca uma marca em Caim, para impedir que o matem (Gênesis 4:15). A Bíblia não diz como era essa marca. Seu propósito, porém, fica claro: Caim seria punido, mas ninguém tinha permissão para tirar sua vida por conta própria. Deus não estava dizendo que o crime foi pequeno; estava impedindo que o assassinato de Abel fosse seguido por outro assassinato.
Mais tarde, depois do dilúvio, Deus declarou que quem derramasse sangue humano deveria responder com a própria vida (Gênesis 9:6). Isso mostra a seriedade com que a Bíblia trata o assassinato. Mas essa ordem aparece muito depois da história de Caim. Não dá pra afirmar que a diferença de época foi *o motivo* de Deus poupá-lo, porque Gênesis 4 não apresenta essa explicação.
Também não precisamos supor que Caim foi poupado porque havia poucas pessoas na terra, ou porque Deus precisava que ele tivesse descendentes. O texto conta que Caim formou uma família (Gênesis 4:17), mas não diz que essa foi a razão da sentença.
Portanto, a resposta mais honesta é: Deus escolheu punir Caim sem matá-lo, mas não revelou por quê. A história deixa duas coisas claras ao mesmo tempo: a vida de Abel tinha valor, e Caim não saiu sem castigo; ainda assim, Deus não entregou a outras pessoas o direito de se vingarem dele.